Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ciao1Q99KN2 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ciao1Q99KN2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ciao1Q99KN2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms