Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pacsin3Q99JB8 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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