Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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