Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vps11Q91W86 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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