Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms