Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms