Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm12154-201ENSMUST00000145584 445 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC140209.1-203ENSMUST00000227412 1524 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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