Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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