Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rufy1Q8BIJ7 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms