Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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