Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms