Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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