Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms