Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb40Q6PCS8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms