Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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