Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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