Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms