Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bhlha9Q5RJB0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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