Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms