Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms