Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms