Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms