Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms