Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms