Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pitx2P97474 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms