Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphp4P59240 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms