Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Aqp4P55088 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms