Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpbP50405 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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