Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxc13P50207 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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