Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ighm-202ENSMUST00000177715 1698 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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VdrP48281 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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