Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rph3aP47708 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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