Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms