Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
TP20293 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
TP20293 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
TP20293 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TP20293 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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