Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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