Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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