Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm3239L7N2D9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm3239L7N2D9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm3239L7N2D9 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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