Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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