Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms