Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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