Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Trim39Q9ESN2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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