Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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