Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms