Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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