Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms