Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms