Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms