Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Card11Q8CIS0 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Card11Q8CIS0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms