Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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