Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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