Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vwa8Q8CC88 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwa8Q8CC88 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms